A Divisão Financeira busca a excelência na gestão dos recursos financeiros e patrimoniais do Instituto. Atua para assegurar o uso adequado dos recursos públicos, o cumprimento da legislação vigente e presta suporte às atividades institucionais. A área é responsável pela gestão, execução e controle dos recursos orçamentários que são colocados à disposição do Instituto. Presta assessoria técnica à Direção, auxiliando na tomada de decisões, e coordena os serviços do almoxarifado, compras, contabilidade, escritório de apoio à pesquisa, patrimônio e tesouraria.
Recepciona as demandas de compra, de acordo com a legislação em vigor, e fornece informações ao Sistema de Consolidação (SCT) do Tribunal de Contas do Estado (TCE).
Controla e repõe o estoque. Executa a logística de distribuição dos materiais no Instituto. Acompanha a entrega e realiza a conferência dos itens recebidos. Gerencia o patrimônio.
Oferece orientação e suporte operacional na elaboração e prestação de contas dos projetos FAPESP. Auxilia em determinadas atividades de tesouraria.